9月7日上午9时35分，南宁火车站的一名男性旅客突然跳入轨道，与正在减速停靠的C8668次列车发生了碰撞。列车立即采取紧急制动措施，但由于距离过近，未能及时避开。事后，站方迅速启动应急预案，联系了急救和消防部门进行现场救助。大约在9时50分，医护人员赶到并对该旅客进行了急救，但到10时24分确认其已无生命迹象。C8668次列车于10时56分恢复正常运营。
事故发生后，网络上开始流传有关该列车在南宁站延迟的消息。12306铁路部门证实，C8668的延误是由于列车调度原因，未停运。目击乘客王先生回忆，当时他正在7号车厢候车，听到现场传来骚动，而列车在事故后停了下来，随后工作人员疏导旅客至候车厅。8号车与出站口楼梯靠近，事件发生时距离王先生并不远。另一名乘客则表示，他们也被告知在列车停靠时不得下车，直到一个小时后才被允许离开。原本计划在9时36分到达南宁站的列车因此延误。
